Projet de recherche : analyse fonctionnelle de l'interaction vigne-oïdium

Analyse fonctionnelle de l'interaction vigne-oïdium, grâce à une combinaison d'approches génomique, transcriptomique et métabolomique, se déclinant en :

• une analyse intégrée de l’interaction vigne-oïdium
• une identification de métabolites spécifiques d’E. necator pouvant servir de biomarqueurs de l’infection, en vue de l'optimisation du phénotypage de la résistance de la vigne à l’oïdium
• une recherche de protéines effectrices sécrétées par l’oïdium intervenant dans la pathogénicité

Publications représentatives

• P. Mestre, G. Arista, M.–C. Piron, C. Rustenholz, C. Ritzenthaler, D. Merdinoglu & J.–F. Chich (2016) Identification of a Vitis  vinifera endo–β–1,3–glucanase with antimicrobial activity against Plasmopara  viticola, Mol. Plant Pathol., 18, 708–719.
• D. Costechareyre, J.–F. Chich, J.–M. Strub,  Y. Rahbé & G. Condemine (2013) Transcriptome of Dickeya dadantii infecting Acyrthosiphon pisum reveals a strong defense against antimicrobial peptides, PLOSone, 8(1), e54118.
• J.–F. Chich, C. Chapuis, C. Henry, J. Vidic, H. Rezaei  & S. Noinville (2010) Vesicle permeabilization by purified soluble oligomers of prion protein: a comparative study of the interaction of oligomers and monomers with lipid membranes. J. Mol. Biol., 397, 1017–1030.
• M.–H. Metz–Boutigue, P. Shooshtarizadeh, G. Prévost & J.–F. Chich (2010) Innate immunity and antimicrobial peptides in mammals  Curr. Pharmac. Des., 16, 1024–1039.
• J.–F. Chich, O. David,  F. Villers, B. Schaeffer, D. Lutomski  & S. Huet  (2007) Statistics for proteomics:  experimental design  and  2–DE  differential  analysis.  J.  Chrom.  B,  849, 261–272.
• P.  Rigolet, I. Méchin, M.–M. Delage  & J.–F. Chich (2002) The  Structural Basis  for Catalysis  and Specificity of the X–prolyl dipeptidyl aminopeptidase from Lactococcus lactis. Structure, 10, 1383–1394.
• M.–C. Champomier–Vergès, E. Maguin, M.–Y. Mistou, P. Anglade & J.–F. Chich (2002) Lactic acid bacteria and proteomics: current knowledge and perspectives. J. Chrom.  B,771 (1–2) 329–342.
• P. Anglade, E. Demey, V. Labas, J.–P. Lecaer & J.–F. Chich (2000) Towards a proteomic map of Lactococcus lactis  NCDO 763. Electrophoresis, 21, 2546–2549.

Parcours

• Depuis 2011 : Inrae Colmar, UMR SVQV
• 2008 - 2010 : Mise à disposition Unité 977 INSERM, équipe Neuropeptides Bioactifs, Strasbourg
• 2000 - 2008 : Unité Virologie et Immunologie Moléculaires, Inra Jouy-en-Josas
• 1991 - 2000 : Chargé de recherche, Unité de recherche de Biochimie et Structure des Protéines, équipe Enzymologie, Inra Jouy-en-Josas
• 2005 : Habilitation à Diriger des Recherches, “Du portrait d’une enzyme bactérienne à la photo de groupe de protéines neuronales”. HdR délivrée par l’Université de Versailles–Saint Quentin en Yvelines
• 1990 : Thèse de Doctorat de l'Université Paris VI,  “Un  nouveau canal ionique mitochondrial : blocage par une séquence d’adressage et localisation sur la membrane  externe”, Directeur de  thèse : Dr Jean–Pierre Henry (DR CNRS)